“十四五”期间，学校进一步深化医教协同，全面推动附属医院高质量发展。加强对附属医院的全面管理，实现对附属医院管理、支持和考核的“三个同质化”，推动各附属医院的医、教、研能力水平全面提升。各附属医院推动技术创新和管理创新，医疗质量和服务能力稳步提升。各附属医院在国家三级公立医院绩效考核排名中整体实现晋位升级，第一附属医院位列全国综合医院第39名，第二附属医院位列全国第122名，第三附属医院位列全国肿瘤专科第8名，附属口腔医院位列全国口腔专科第46名。
夯实附属医院临床医学教育主阵地。“十四五”期间，附属医院抓实教育教学和人才培养质量，依托直属附属医院建设的临床医学学科进入ESI全球前1.86‰，临床医学入选国家一流专业、医学检验技术入选云南省一流专业，新增老年医学与健康本科专业招生，推进临床医学、医学检验专业中法人才联合培养项目。第三附属医院开展“专科医院与综合医院互补教学联盟”贯通式培养临床医学专业学生成效显著，获“全国临床医学专业（本科）水平测试先进单位”。附属口腔医院口腔医学实验中心的“口腔智慧多模态数字化技能训练中心建设”项目入选教育部产学合作协同育人项目。“十四五”期间，四所附属医院累计共有高级职称1900余人，博士900余人，硕士3000余人，引进院士1人；累计入选“兴滇英才支持计划”医疗卫生人才100余人，研究生导师名额较“十三五”期间有较大幅度的增加。学校全面落实国家深化医教协同的要求，进一步推进医学教育改革与发展，尤其是加强临床医学人才培养的要求，实现对附属医院管理、支持和考核“三个同质化”。出台《bat365在线平台附属医院教育教学工作考核指标体系（试行）》《bat365在线平台附属医院专项业务考核实施办法》，给予专项经费支持各附属医院教育教学业务工作开展，推动各附属医院的医、教、研能力水平全面提升。
科研和临床研究取得显著成效。“十四五”期间，第一附属医院各类科研立项1228项。获批国家重点研发计划1项，国家自然科学基金项目立项181项，国家科技重大专项课题、子课题获批立项17项，获云南省科技成果奖34项；批准建设4个国际联合实验室，开展全球首例猪-人肝、肾联合异种移植。第二附属医院获批国家自然科学基金立项60项，省重大科技专项3项，获省级科技创新团队3项。作为第二完成单位首次获华夏医学科技奖一等奖；获云南省神经精神疾病研究重点实验室；泌尿外科获批“膀胱癌早期诊疗国家临床医学研究中心”。第三附属医院获批国家自然科学基金立项44项，持续领跑全省临床试验建设，跻身全国百强临床试验机构。附属口腔医院累计新增科研项目230项，国家自然基金项目18项，获批口腔医学一级学科博士学位点和专业学位博士点。
附属医院医疗质量和服务能力稳步提升。“十四五”期间，四所直属附属医院开放床位总数达到8000余张，诊疗人数达2655万人、手术人次达65万人。其中，第一附属医院总诊疗人次1512.3万，出院人次87.5万，手术台次34.2万，四级手术占比最高达32.44%，CMI值最高达1.6027，开放床位4480张，互联网医院服务患者32.7万人次，建成省内首家“一站式”服务中心，积极推进多院区同质化管理。第二附属医院总诊疗人次达734.15万，手术台次21.32万、四级手术占比24.30%，CMI值1.5373，开放床位2978张。第二附属医院凭借健康管理领域的突出实力，获评全国体重管理中心建设研究重点项目单位；泌尿外科获批膀胱癌早期诊疗国家临床医学研究中心。第三附属医院总诊疗人次达341.1万，手术台次13.3万、四级手术占比50.9%，CMI值1.3203，开放床位1578张，发展“互联网+医疗”，成为全国首家实现联网医院医保药品“双通道”处方流转的医院。附属口腔医院“十四五”期间就诊人次217.8万，四级手术占比4.88%，CMI值2.1423。近5年门诊人次年平均递增超过15%，业务收入年平均增长11.45%。第一附属医院挂牌“云南省国际诊疗保健合作中心”，被指定为省内第一批国际医疗服务试点医院。第二附属医院连续举办“金桥”国际泌尿外科研讨会暨微创泌尿外科新技术培训班。第三附属医院成为省卫健委指定的孟加拉民众赴滇就医机构之一。附属口腔学院（医院）先后主办“两岸口腔医学学术交流论坛”“中国-东南亚口腔医学教育交流与合作论坛”“南亚-东南亚口腔医学学术会议”。与泰国玛希隆大学牙学院在线签署博士合作项目协议。四所直属附属医院全面贯彻《云南省卫生健康事业高质量发展三年行动计划》，扎实推进“强县级、强基层、管慢病、控疾病、重妇幼、强人才”等重点工程，承接并实施全省“壮大执业（助理）医师队伍计划”“公共卫生队伍强基固本计划”“基层医疗卫生人员技能培训计划”等项目，有效带动全省基层医疗卫生服务能力整体提升。在国家区域医疗中心建设方面，第三附属医院成功获批第二批国家区域医疗中心试点项目。四所直属附属医院国家级临床重点专科建设实现重大突破，累计获批16个国家级临床重点专科，超额完成规划目标。在国家三级公立医院绩效考核中，第一附属医院位列全国综合医院第39名，稳居A+等级；第二附属医院位列全国第122名，进入前10%；第三附属医院位列全国肿瘤专科第8名，展现出显著的专科实力；附属口腔医院位列全国口腔专科第46名，均完成规划晋位升级目标。
